檢方懷疑扁家來路不明的現金，包括企業行賄款、金改政策索賄款、機要費不需單據的每月200萬元源源不絕，而且“經年累月，堆積成山”，檢方說，如是合法的資金往來在銀行作業即可，何苦載重、搬運？確認扁家大收黑錢，偏愛現金。此外，更明顯的證據是，陳水扁未被羈押前向特偵組供稱，曾資助台當局前行政院長游錫堃、立委蔡同榮、廣告人郝廣才2000 萬元、1000萬元開銷，當事人証稱確實領到錢，但檢方卻查
前民進黨主席施明德28日到台北地院出庭，為兩年前紅衫軍運動證明自己的清白。針對杜麗萍承認送兩億元到扁珍官邸，還有扁家除海角七億另外又再爆發七點四億元，甚至這些搬錢的時間點，竟然都是在紅衫軍如火如荼倒扁的時候，施明德氣憤的表示，已經找不到任何詞匯形容扁家的貪腐，他痛批陳水扁的髒手不止伸進國務機要費甚至土地買賣、賤售國有財產，陳水扁身影簡直無所不在。
據台灣《聯合晚報》報導，台灣特偵組偵辦扁家洗錢案查出元大證券董事杜麗萍2005年間涉嫌以水果箱送2億元新台幣進陳水扁的玉山官邸，在此之前，並傳出陳水扁夫人特助蔡銘哲搬運至少1 億元現金入官邸，兆豐金前董事長鄭深池也運1億元現金入官邸，外傳玉山官邸有個容納現鈔的“現金倉庫”似乎已被證實。
台灣最高檢特偵組再次出動搜索，並申押元大證券董事杜麗萍，儘管杜女28日上午己獲交保；但國民黨立委邱毅28日強調，這個搜索和申押的動作與中信金控大少辜仲諒的補充書狀有關。 據中評社報導，邱毅並強調，辜仲諒提供特偵組的企業行賄名單很詳細，他呼籲曾經送錢到陳水扁家，或是從島外匯錢給扁家的人或是企業趕快自首，再晚就來不及了。
